YASARA Model——分子结构分析软件
YASARA Model = YASARA View + 结构分析功能
YASARA Model包含YASARA View和所有你在采样阶段所需要的所有功能，包括探索、分析、小分子到大分子，分析和建模小到大分子在生产环境中的功能。这包括许多功能，有些你很少听说的：如无限撤销/恢复，macro记录，快门式眼镜或立体画面的四缓冲立体。你可以在同时加载数千结构文件，然后单独移动它们，并创建多媒体演示文件（YASARA视频）。这些电影可以被编码为MPEG文件，然后粘贴到PowerPoint文件中，对YASARA的各个阶段模拟进行回放。
主要特点：
•包含YASARA View的所有特点。
•通过sterescopic屏幕或快门眼镜可以体验完全身临其境的OpenGL三维立体图形。高品质的GPU加速浮雕立体模型可以通过红色/青色眼镜观察到，扑面而来的全彩色，笔记本电脑亦可以实现。
•创建奇幻的分子动画，包括自动旋转，移动，缩放，三维字母，纹理映射PNG/ JPG图像，并转换为3D对象的文本。
•编制MPEG格式的动画，并将其粘贴到PowerPoint演示文稿。
•导入OpenOffice Impress的和Microsoft PowerPoint演示文稿中，添加分子动画。
•同时打开成千上万的结构，独立移动它们。
•广泛的协调操作：中心，连接，转换，寡聚体化，转化片段（如loop），或折叠（如域）。
•分析接触，氢键，疏水/π-π/阳离子-π相互作用和蛋白质二级结构。
•自动比对小分子如配体，如通过叠加配体的最大共同片段。
•测量原子团之间的距离，角度和二面角，如螺旋链与侧链平面。
•改变距离，角度和二面角。
•分配部分化学键并加氢时，从0到14选择默认的pH值。
•显示和计算范德华、分子和溶剂可及表面，区分外表面和内表面，计算其体积。分析和展示了表面形成空腔。
•创建多个交互式切割面，深入观察内表面和其他物体。
•自动识别顺式肽键和有问题的stereoisome res。
•储存您的分析结果，并导入Excel中。
•记录macros或以文本编辑器编辑。
•支持像空间球和P5手套的特殊输入设备（目前仅适用于Linux）。
•无限撤销/恢复。
