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YASARA Model——分子结构分析软件

YASARA Model = YASARA View + 结构分析功能

 

YASARA Model包含YASARA View和所有你在采样阶段所需要的所有功能,包括探索、分析、小分子到大分子,分析和建模小到大分子在生产环境中的功能。这包括许多功能,有些你很少听说的:如无限撤销/恢复,macro记录,快门式眼镜或立体画面的四缓冲立体。你可以在同时加载数千结构文件,然后单独移动它们,并创建多媒体演示文件(YASARA视频)。这些电影可以被编码为MPEG文件,然后粘贴到PowerPoint文件中,对YASARA的各个阶段模拟进行回放。

 

主要特点:
•包含YASARA View的所有特点。
•通过sterescopic屏幕或快门眼镜可以体验完全身临其境的OpenGL三维立体图形。高品质的GPU加速浮雕立体模型可以通过红色/青色眼镜观察到,扑面而来的全彩色,笔记本电脑亦可以实现。
•创建奇幻的分子动画,包括自动旋转,移动,缩放,三维字母,纹理映射PNG/ JPG图像,并转换为3D对象的文本。
•编制MPEG格式的动画,并将其粘贴到PowerPoint演示文稿。
•导入OpenOffice Impress的和Microsoft PowerPoint演示文稿中,添加分子动画。
•同时打开成千上万的结构,独立移动它们。
•广泛的协调操作:中心,连接,转换,寡聚体化,转化片段(如loop),或折叠(如域)。
•分析接触,氢键,疏水/π-π/阳离子-π相互作用和蛋白质二级结构。
•自动比对小分子如配体,如通过叠加配体的最大共同片段。
•测量原子团之间的距离,角度和二面角,如螺旋链与侧链平面。
•改变距离,角度和二面角。
•分配部分化学键并加氢时,从0到14选择默认的pH值。
•显示和计算范德华、分子和溶剂可及表面,区分外表面和内表面,计算其体积。分析和展示了表面形成空腔。
•创建多个交互式切割面,深入观察内表面和其他物体。
•自动识别顺式肽键和有问题的stereoisome res。
•储存您的分析结果,并导入Excel中。
•记录macros或以文本编辑器编辑。
•支持像空间球和P5手套的特殊输入设备(目前仅适用于Linux)。
•无限撤销/恢复。

 

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