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YASARA——综合分子模拟软件包

YASARA是一款多功能分子模拟商业软件,可用于分子结构可视化,结构分析,分子动力学模拟,分子对接,同源模建,NMR数据预测蛋白质结构等。

 

YASARA软件的由来
YASARA(Yet Another Scientific Artificial Reality Application)软件,是由奥地利格拉兹大学的Elmar Krieger开发并逐步发展的。1997年,YASARA的开发成为了Elmar的硕士软件题目。2000年,Elmar开始就读Prof . Gert Vriend的博士,并在此过程中进一步的完善YASARA软件。2002年,Elmar成立了YASARA Biosciences公司,开始YASARA的商业化推进过程。2003年,YASARA开始和WHAT IF合作,使得WHAT IF 变得更易于操作。2006年,YASARA开始和Spronk NMR咨询公司合作,开发自己的NMR模块。至此,YASARA软件基本成型。
YASARA软件包含5个基本模块:

1、YASARA View: 基本的可视化模块,是一个完全免费的模块
2、YASARA Model: YASARA View+结构分析功能
3、YASARA Dynamics: YASARA Model+分子动力学模块
4、YASARA Structure: YASARA Dynamics+分子对接模块+同源模建模块
5、YASARA NMR Module:NMR数据预测蛋白质结构
6、扩展模块YASARA/WHAT IF Twinset:结构模建以及验证

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