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分子动力学高性能计算平台

平台设计原

分子动力学并行计算模拟平台软件硬件搭建,提供包括linux操作系统、分子动力学GPU并行计算环境,科学计算数学库及编译器安装、调试和系统优化服务;

可支持快速载入并高清显示大分子结构,支持分析蛋白大分子和药物小分子的氢键,疏水等相互作用;支持计算并显示范德华表面,分子表面以及溶剂可及性表面;支持一键分子对接并分析结果;支持同源模建,可自动实现多模板搜索与比对,杂合建模等功能;支持实时显示分子动力学模拟过程和GPU加速运算。
平台基于英特尔至强处理器,最高44个计算核心88线程,最大256GB物理内存,40TB系统存储空间,8块GPU加速卡, 27寸液晶显示器;专用光电键鼠套装;专用电源;高效低噪音散热系统;
安装VMD、PYMOL、Chimera分子结构显示软件
安装分子动力学软件GROMACS、并配置GPU并行计算
安装分子动力学软件amber14,、并配置GPU并行计算
安装可视化分子动力学计算模拟软件YASARA
提供平台使用中文手册;提供分子模拟过程中的相关技术支持服务。

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